建筑工程学院的前身主要是原江西工学院的土木建筑工程系，自1958年创系后，于当年招收了第一届工业与民用建筑专业学生，次年建筑学专业开始招生，以后经历过专业下马、师生下放等变动，全系师生曾辗转萍乡、武宁、景德镇等地，办学实力大受损伤。学校恢复招生后，土木建筑工程系于1970年招收了水利水电专业学生，1972年恢复了工民建专业，1981年恢复了建筑学专业，1985年学校更名为江西工业大学后，系里又于1987年增设了给水排水专业。1993年南昌大学成立后，在原土木建筑工程系的基础上，分别组建了土木工程系、建筑学系、水利电力工程系和工程力学研究所。
学校为了适应扩并后管理的需要，推行了校、院、系（所）三级管理制，由此，建筑与环境工程学院得以成立，2003年更名为建筑工程学院。学院现有建筑学、土木工程、水利工程3个系和工程力学实验中心，下设设计基础、建筑设计、建筑技术与理论、城市规划、美术、工程结构、工程管理、道桥工程、给排水科学与工程、建筑节能、水工、水资源与水信息、遥感与测绘、工程力学14个教研室，并设有建筑学、土木工程、给排水、建筑环境与节能、工程设计、水利、工程力学7个实验中心。
学院现有固体力学1个博士点，土木工程、水利工程、力学等3个一级学科和建筑设计与理论二级学科硕士点，建筑与土木工程和水利工程两个专业硕士领域 。建筑设计及其理论和工程力学为江西省“十五”重点学科，固体力学为江西省“十一五”重点学科，力学为江西省“十二五”示范性硕士学科。设置了建筑学、城市规划、土木工程（含建筑工程、道路桥梁工程2个方向）、工程管理、给排水科学与工程、建筑环境与节能应用、水利水电工程、工程力学8个本科专业。（其中建筑学和土木工程为江西省品牌专业，土木工程为江西省特色专业）。拥有国家级实验教学示范中心1个，国家级虚拟仿真教学实验中心1个，省级实验教学示范中心1个，人才培养基地18个，校外实习基地26个，省级精品课程5门，校级优质课程8门，校级重点建设课程13门，精品资源共享课程2门。
学院以学科建设为龙头，以科研为动力，面向江西经济建设，瞄准高科技发展趋势，积极与产业部门结合，形成了若干个高水平的研究方向，承担了一批国家级、省部级项目，取得了一批具有国际和国内先进水平的研究成果，获得多项国家级、省部级奖励。承接了一批典型的效益大的工程项目，完成横向科研课题近百项，为工程实际解决了大量技术难题，获得了巨大的社会和经济效益。
近年来，学院通过开展对外设计、咨询、试验、工程质量检测、工程建设监理、技术培训等对外有偿技术服务，促进了教学、科研实验条件的改善，丰富了中青年教师的工程实践经验。学院在注册建筑师、注册规划师、工业与民用建筑工程、市政工程、水利电力工程、道桥工程、建筑工程质量检测、工程监理、全国监理工程师培训和造价工程师培训（国家建设部批准定点单位）、工程地质勘探、水工模型实验、建筑工程测量和注册结构工程师培训等多方面可以承担设计、实验、技术咨询及培训等任务。
建筑工程学院具有优良的传统，工作作风扎实，教师治学严谨、教学要求严格，学术研究氛围浓厚。本学院注重培养学生扎实的理论基础和合理的知识结构，掌握现代化工程新技术新知识，强化学生素质与能力的培养，就业范围广泛，竞争和适应能力强，受到用人单位的欢迎。学院经过50余年的办学历程，为社会培养了大批专业技术人才，其中大部分已成为国家建设的骨干力量，并造就了一批成就突出的学者、专家、教授和管理人才，在国内外施展才华。我们愿与社会各界一道，为我们国家美好的明天而贡献力量。